三種選擇模式（directional, stabilizing, disruptive）是量化遺傳學的核心分類，現代以多元梯度分析、實驗演化、基因組掃描等方法精密量化。
Lande-Arnold 多元選擇分析
Lande & Arnold（1983）推廣 Pearson 選擇方法至多特徵系統：
w(z) = α + β'z + (1/2)z'γz + ε
其中：
- β：directional selection gradient（線性係數向量）
- γ：non-linear selection（二次矩陣）
- γ_ii < 0：穩定選擇（特徵 i）
- γ_ii > 0：分裂選擇
- γ_ij ≠ 0：相關性選擇
直接量化各選擇成分強度。Kingsolver et al.（2001）綜述 63 項研究發現 |β| 中位數 0.16，遠強於 |γ|（0.10），意味著方向選擇普遍強於非線性選擇。
選擇反應與遺傳變異
Breeder's equation：R = h²S（單性狀）
多性狀：Δz̄ = G β（G 為附加遺傳變異-協變異矩陣）
G 矩陣的形狀決定演化軌跡——若 G 主軸與 β 方向不對齊，演化會偏離選擇方向（'genetic line of least resistance', Schluter 1996）。
Reaction Norms 與穩定選擇
穩定選擇在多變環境下可演化出「環境敏感性」：基因型 × 環境交互作用允許表型可塑性（phenotypic plasticity）維持中央適應。
選擇與分子訊號
- 正選擇（方向）：
- dN/dS > 1 在編碼區
- selective sweep 留下低多樣性 + LD 增加
- iHS, XP-EHH 等 haplotype 方法檢測近期 sweep
- 平衡選擇（部分穩定）：
- 維持高 heterozygosity
- HLA、ABO 為典型範例
- 分裂選擇：
- 在 sympatric speciation 中可由 magic trait（同時影響適應與配偶選擇）驅動
- 基因組島嶼（islands of differentiation）為分子指紋
Adaptive Radiation 與選擇模式
Schluter（2000）提出 ecological speciation 模型：分裂選擇 + 適應性配偶選擇 + 棲位差異化 = 物種輻射。Lake Victoria 慈鯛、Hawaii honeycreeper、Anolis 蜥蜴為經典案例。
選擇強度的時空變異
野外選擇強度高度變異：
- Hereford et al.（2004）：β 在年際間波動係數可達 1.0
- 旱季/雨季交替使選擇方向反轉
- 颱風、極端天氣造成短期強選擇
Fluctuating selection 可維持遺傳變異（透過 storage effect），是 maintaining polymorphism 的機制之一。
人為選擇與全球變遷
- 漁業誘導演化：過度捕撈大個體導致魚體小型化、提早成熟（Olsen et al., Nature 2004）
- 狩獵誘導：北美 trophy hunting 使大角羊角部變小（Coltman et al., Nature 2003）
- 抗藥性演化：抗生素、農藥、抗瘧藥皆驅動目標族群快速演化
- 氣候變遷下相位變化：野花、昆蟲、鳥類的物候（phenology）面臨強方向選擇
Selection-mutation balance
有害等位基因頻率達 q* = √(μ/s)（純隱性），μ = 突變率、s = 選擇係數。此平衡解釋為何遺傳病等位基因雖有害仍持續存在於族群中——突變持續產生而選擇來不及清除。
Sexual conflict 與穩定/分裂選擇
雌雄對同一性狀的選擇方向不同（intralocus sexual conflict）會產生看似穩定選擇的整體 pattern，但實際存在拉鋸。X-linked 與 autosomal 基因受性別差異影響不同。
Replicated Experimental Evolution
Lenski 大腸桿菌長期演化實驗（1988-今）追蹤 75,000+ 代演化，揭示方向選擇、停滯（diminishing returns epistasis）、突發性新功能（aerobic citrate utilization）等多種演化動態。