卵裂（cleavage）是受精後的高速細胞分裂期，其分子特徵是截短的細胞週期（僅 S-M 交替，缺乏 G₁ 和 G₂ 期），由母源儲存的 cyclin B 和 Cdc25 磷酸酶驅動 CDK1 的振盪活化。
細胞週期調控的獨特性
非洲爪蟾卵裂期的細胞週期約 30 分鐘，由預存的 cyclin B mRNA 翻譯和 APC/C（anaphase-promoting complex）介導的 cyclin B 週期性降解所驅動。DNA 複製檢查點（checkpoint）在早期卵裂中幾乎不啟動——這解釋了為什麼卵裂期的 DNA 損傷修復能力較差（Shimuta et al., 2002, EMBO J）。
中期囊胚轉換（MBT, Midblastula Transition）
MBT 標誌著從母源基因表達轉向合子基因組活化（ZGA, Zygotic Genome Activation）。在非洲爪蟾中，MBT 發生在第 12 次卵裂（約 4000 細胞），其觸發機制涉及核質比（N/C ratio）模型：隨著細胞數增加而核 DNA 總量增加，核 DNA 作為母源轉錄抑制因子（如組蛋白和 Duf domain 蛋白）的「海綿」，當抑制因子被滴定殆盡時，合子轉錄啟動（Amodeo et al., 2015, Current Biology）。然而，近年研究發現 ZGA 的時序也受到特定先驅轉錄因子（如 Zelda/DPL 在果蠅中、Nanog/Oct4 在哺乳類中）的調控，並非完全由核質比決定。
哺乳類卵裂的獨特特徵
哺乳類卵裂異常緩慢（每次約 12-24 小時），且具有調節性（regulative）——每個裂球在早期具有全能性，移除或增加裂球仍能發育為完整胚胎（這是同卵雙胞胎的發生基礎）。壓實化（compaction）在 8 細胞期由 E-cadherin 依賴性細胞黏附驅動，建立上皮極性（apical-basolateral polarity），外側裂球表達 aPKC 和 Par6，通過 Hippo 信號通路的差異活化決定第一次細胞命運分化：外層（高 YAP/TAZ 核定位）→ 滋養外胚層（TE）；內層（Hippo 活化，YAP 被磷酸化留在細胞質）→ 內細胞群（ICM）（Nishioka et al., 2009, Dev Cell）。
囊胚腔形成的力學與分子機制
囊胚腔（blastocoel）的形成需要：（1）TE 細胞建立上皮屏障（tight junctions，claudin 和 occludin）；（2）基底面的 Na⁺/K⁺-ATPase 和 aquaporins 驅動液體跨上皮轉運（transepithelial fluid transport）。近期活體成像研究（Chan et al., 2019, Nature）揭示囊胚腔形成涉及機械力學回饋——液壓（hydrostatic pressure）的增加會破壞部分細胞間連接，引起壓力脈動（pressure oscillations），直到上皮屏障完全成熟。此機械過程也參與 ICM/TE 命運決定。