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1 · 第2學期生物統計生物學應用

流行病學統計

Epidemiological Statistics

難度 3 · 進階statisticsepidemiology

流行病學統計的進階主題涉及因果推論方法學、DAG 和傳染病建模。

DAG 與因果推論

Pearl 的 DAG 框架區分三種非因果路徑:(1) backdoor path(confounding),(2) collider path(控制 collider 開啟偏差),(3) mediator path(中介)。Backdoor criterion 指導變數調整:阻斷所有 X → ... → Y 的非因果路徑。實用工具:DAGitty(dagitty.net)繪製 DAG 並自動判斷最小調整集。

傾向分數方法(Propensity Score Methods)

Rosenbaum & Rubin(1983):e(X) = P(A=1|X)。將多維共變數壓縮為一維分數。應用:(1) PS matching,(2) IPTW,(3) PS stratification,(4) PS covariate adjustment。Doubly robust estimator(Bang & Robins, 2005):結果模型或 PS 模型至少一個正確即可一致。Targeted Maximum Likelihood Estimation(TMLE, van der Laan & Rose, 2011)是更現代的 doubly robust 方法。

E-value(VanderWeele & Ding, 2017)

量化「需要多強的未測量干擾才能解釋觀察到的關聯」。E-value = RR + √(RR × (RR−1))。E-value 越大,觀察到的關聯越不容易被未測量干擾解釋掉。提供 sensitivity analysis 的簡潔指標。

傳染病動態模型

  • SIR 模型:dS/dt = −βSI/N,dI/dt = βSI/N − γI,dR/dt = γI。R₀ = β/γ(基本再生數)。R₀ > 1 則疫情擴散。
  • SEIR(加 Exposed 潛伏期)和 age-structured models 更精確。
  • Stochastic branching process:早期小規模疫情的隨機性需 stochastic model。R_t(有效再生數)的即時估計以 Wallinga-Teunis(2004)或 EpiEstim(Cori et al., 2013)方法。

疫苗效力/效果(VE)

VE = 1 − RR = 1 − (attack rate in vaccinated / attack rate in unvaccinated)。Test-negative design(TND)是流感和 COVID-19 疫苗效果的標準觀察性設計,以就醫但檢測陰性者為對照。

文獻參考:Rothman, K.J. et al. (2008). Modern Epidemiology, 3rd ed. / VanderWeele, T.J. & Ding, P. (2017). Ann Intern Med, 167, 268-274. / Cori, A. et al. (2013). Am J Epidemiol, 178, 1505-1512.

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